1. Probava i apsorpcija proteina u tijelu se postižu putem aminokiselina:Kao primarni nutrijent u tijelu, uloga proteina u ishrani je očigledna, ali tijelo ih ne može direktno iskoristiti. Umjesto toga, pretvara se u male molekule aminokiselina.
2. Ima ulogu u balansu azota:Kada su kvalitet i količina proteina u dnevnoj prehrani odgovarajući, količina unesenog dušika jednaka je količini koja se izlučuje izmetom, urinom i kožom. To se zove ukupna ravnoteža dušika. Ovo je zapravo ravnoteža između kontinuirane sinteze i razgradnje proteina i aminokiselina. Dnevni unos proteina normalne osobe trebao bi ostati u određenom rasponu. Čak i uz naglo povećanje ili smanjenje unosa, tijelo i dalje može regulirati metabolizam proteina kako bi održalo ravnotežu dušika. Međutim, prekomjeran unos proteina premašuje sposobnost tijela da reguliše ovu ravnotežu, narušavajući ovaj mehanizam. Čak i bez proteina, proteini tkiva će se i dalje razgraditi, što će dovesti do trajnog negativnog balansa dušika. Ako se korektivne mjere ne preduzmu odmah, to će na kraju dovesti do smrti antitijela.
